Panda Anti-Rootkit je paket namijenjen uklanjanju tzv. rootkit programa – programa dizajniranih da skrivaju od korisnika određene zlonamjerne procese, datoteke ili upise u Windows Registry zapisnik, što hakeri najčešće koriste za prikrivanje tragova ili tajno umetanje zlonamjernih programa u ranjivi sustav. Podržan je na Windows 2000 SP4, XP, XP SP1, XP SP2, 2000 i 2003 operacijskim sustavima. Budući da tradicionalni antivirusni programi nemaju mogućnost otkrivanja takvih programa, Panda Anti-Rootkit se koristi za otkrivanje skrivenih procesa, upravljačkih programa (eng. driver), skrivenih modula i datoteka te upisa u registry i sl. Nakon odstranjivanja rootkit programa, preporuča se i pokretanje nekog antivirusnog programa za čišćenje tako uočenih prijetnji. Instalacija je vrlo jednostavna te se sastoji od pokretanja PAVARK.exe programa, nakon čega je moguće odabrati dva tipa skeniranja računala – obično i duboko, pri čemu duboko zahtjeva prethodno ponovno pokretanje računala. Prilikom skeniranja, u prozoru je moguće pratiti napredak i rezultate. Nakon skeniranja, u slučaju pronađenih prijetnji, prikazuje se njihov popis i mjesto na disku na kojem se nalaze te se nudi opcija njihovog brisanja, pri čemu su poznate prijetnje automatski određene za brisanje, dok je za nepoznate ipak potrebna intervencija korisnika. Osim toga, postoji i opcija dodatnog izvještaja, koji nudi neke informacije o karakteristikama uočenih programa i može se eksportirati u CSV datoteku. Nakon čitavog postupka, potrebno je ponovno pokrenuti računalo kako bi se uspješno završio proces čišćenja, jer do te točke rootkit programi ostaju aktivni. U svakom slučaju, alat je vrlo jednostavan za korištenje, a može poprilično pomoći u očuvanju sigurnosti sustava pa se stoga preporuča svim korisnicima.